Parameter estimation of kinetic models from metabolic profiles: two-phase dynamic decoupling method

نویسندگان
چکیده

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Parameter estimation of kinetic models from metabolic profiles: two-phase dynamic decoupling method

MOTIVATION Time-series measurements of metabolite concentration have become increasingly more common, providing data for building kinetic models of metabolic networks using ordinary differential equations (ODEs). In practice, however, such time-course data are usually incomplete and noisy, and the estimation of kinetic parameters from these data is challenging. Practical limitations due to data...

متن کامل

Ensemble Kinetic Modeling of Metabolic Networks from Dynamic Metabolic Profiles

Kinetic modeling of metabolic pathways has important applications in metabolic engineering, but significant challenges still remain. The difficulties faced vary from finding best-fit parameters in a highly multidimensional search space to incomplete parameter identifiability. To meet some of these challenges, an ensemble modeling method is developed for characterizing a subset of kinetic parame...

متن کامل

Decoupling dynamical systems for pathway identification from metabolic profiles

RATIONALE Modern molecular biology is generating data of unprecedented quantity and quality. Particularly exciting for biochemical pathway modeling and proteomics are comprehensive, time-dense profiles of metabolites or proteins that are measurable, for instance, with mass spectrometry, nuclear magnetic resonance or protein kinase phosphorylation. These profiles contain a wealth of information ...

متن کامل

synthesis of platinum nanostructures in two phase system

چکیده پلاتین، فلزی نجیب، پایدار و گران قیمت با خاصیت کاتالیزوری زیاد است که کاربرد های صنعتی فراوانی دارد. کمپلکس های پلاتین(ii) به عنوان دارو های ضد سرطان شناخته شدند و در شیمی درمانی بیماران سرطانی کاربرد دارند. خاصیت کاتالیزوری و عملکرد گزینشی پلاتین مستقیماً به اندازه و- شکل ماده ی پلاتینی بستگی دارد. بعضی از نانو ذرات فلزی در سطح مشترک مایع- مایع سنتز شده اند، اما نانو ساختار های پلاتین ب...

Parameter Estimation of Loranz Chaotic Dynamic System Using Bees Algorithm

An important problem in nonlinear science is the unknown parameters estimation in Loranz chaotic system. Clearly, the parameter estimation for chaotic systems is a multidimensional continuous optimization problem, where the optimization goal is to minimize mean squared errors (MSEs) between real and estimated responses for a number of given samples. The Bees algorithm (BA) is a new member of me...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Bioinformatics

سال: 2011

ISSN: 1367-4803,1460-2059

DOI: 10.1093/bioinformatics/btr293